يهدف معظم مزارعي الاستزراع النباتي والسمكي إلى ممارسة زراعة المحاصيل العضوية ، وهذا يشمل التأكد من عدم إعطاء الأسماك هرمونات النمو. بدلاً من ذلك ، يتم تغذية الأسماك بنظام غذائي طبيعي يتكون في الغالب من مسحوق السمك وزيت السمك ، والذي يمكن أن يضمن أيضًا مستويات عالية من أوميغا 3.
عندما يتعلق الأمر بعلاج أمراض الأسماك ، يحظر استخدام المضادات الحيوية. نظرًا لأن معظم النظام يعتمد على تحويل الأمونيا والنيتريت إلى غذاء نباتي ، فإن البكتيريا بحاجة إلى التكاثر. في هذه الحالة ، فإن إعطاء المضادات الحيوية يؤدي في الواقع إلى نتائج عكسية وقد يعطل النظام ككل. الطريقة الأكثر شيوعًا لعلاج الأسماك المريضة هي عزلها في حوض منفصل ووضع محلول حمام ملحي.