يهدف معظم مزارعي الاستزراع النباتي والسمكي إلى ممارسة زراعة المحاصيل العضوية ، وهذا يشمل التأكد من عدم إعطاء الأسماك هرمونات النمو. بدلاً من ذلك ، يتم تغذية الأسماك بنظام غذائي طبيعي يتكون في الغالب من مسحوق السمك وزيت السمك ، والذي يمكن أن يضمن أيضًا مستويات عالية من أوميغا 3.
عندما يتعلق الأمر بمعالجة أمراض الأسماك، يتم تقليل استخدام المضادات الحيوية إلى الحد الأدنى ولا يتم إعطاؤها إلا عند وصفها من قبل الطبيب المتخصص. وبما أن معظم النظام يعتمد على تحويل الأمونيا والنتريت إلى غذاء نباتي، فإن البكتيريا تحتاج إلى النمو. في هذه الحالة، فإن إعطاء المضادات الحيوية يؤدي في الواقع إلى نتائج عكسية وقد يؤدي إلى تعطيل النظام بأكمله. الطريقة الأكثر شيوعًا لعلاج الأسماك المريضة هي عزلها في حوض منفصل ووضع محلول الحمام الملحي عليها.